顶管机施工的地层一般会通过淤泥层，腐烂动、植物体会在地下形成有毒气体聚集体，危害施工人员的健康和生命；同时，由于顶管井深、顶进距离长造成管道内缺氧，人在里面作业时容易窒息，所以有人在管内操作时，需要定时监测管内有毒气体的含量，并对井下和管内进行通风，以保证管内作业人员有足够的新鲜空气。
顶管施工中的安全风险管理，是通过风险识别、风险估计和风险评价等来分析顶管施工中的安全风险，并以此为基础，使用多种方法和手段对项顶管施工涉及的安全风险实行有效的控制，尽量扩大安全风险事件的有利结果，妥善地处理安全风险事件造成的不利后果的全过程的总称。包括安全风险识别、安全风险评价以及安全风险控制等几个阶段。
1）水文地质、工程地质方面的因素。顶管施工所处的地质土层变化频繁，如果开工前水文地质资料掌握不准，将会造成施工事故。
2）施工方面的因素。施工方法的选择，施工设备的选用，人员的配备及人员的素质水平等，都将会影响到施工安全。
3）监理、业主方面的因素。如果相关的管理人员专业知识不足，管理能力差，在施工过程中瞎指挥、冒险蛮干，也将会影响到施工安全。
4）设计方面的影响因素。设计方案的可靠性、科学性、针对性与否也会影响到施工过程的安全。
5）经济方面的影响因素。如工程的造价及资金的到位情况等都会影响到施工单位的组织管理。如果工程中标价低，资金到位不及时，承包商为了降低成本，减少安全方面的投入，以及存在侥幸心理等也会影响到施工安全。
